形势的升级
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当地表的战斗持续进行的时候，夏若汐被迫重新深入设施深处，在前进途中她被告知狼穴基地A区的科学家们应当有办法离开被国防军重重包围的狼穴基地。由于狼穴基地内部的交通系统已经瘫痪，夏若汐步行前往她的目的地，随后她到达了已经被外星生物占领了的D区狼穴基地军火库。夏若汐设法在不惊动这些怪物的状况下进入了军火库。与此同时，国防军确定在基地地下失联的小队是被夏若汐杀死，比起歼灭这些不属于地球的怪物，国防军选择更优先的抓住夏若汐，他们通过使用在她实验服上安装的定位装置开始对她进攻并设置陷阱试图解决她。
夏若汐设法到达了C区的暗能物质研究区，在这里国防军正在与一只会使用电力的怪物激战，在强大的火力下，雷电怪很快占据上风并电死了所有士兵。夏若汐为了能够活着离开这里，那股想要生存的愿望使她和因为实验进入了她体内的水晶产生了共鸣，随后她杀死了雷电怪以搭乘手动列车前往A区。
夏若汐在前往A区的路上不断遭到国防军的骚扰，他们试图杀死或活捉她，于是在铁道沿途设置了大量激光绊雷，充能粒子机枪和火箭发射器，甚至他们在墙上涂上了威胁性的标语以威胁夏若汐。尽管处于单枪匹马的劣势，夏若汐还是抵达了A区外围，那时已是日落。
在这之后不久，作为对国防军行动不力的回应，第三帝国领导人阿道夫·希特勒向狼穴基地部署了装甲核心部队（Over Watch）和刺客部队（Assassin），他们的任务是引爆一枚从前苏联得到的完整版AN602彻底摧毁整个设施，并且一劳永逸的终止这里的冲突，他们已经得到命令，无论人类或是异形都格杀勿论。就在两个部队抵达的同时，夏若汐被两名国防军士兵打晕，但是两名士兵违反了将其带回审问的命令，他们收缴了夏若汐从狼穴基地军火库带出的武器并且把她带到了一处较为安全的地方实施了**。之后，夏若汐醒来后侥幸逃脱并穿过了狼穴基地的生物废料处理设施。离开处理厂后夏若汐发现他来到了黑山基地最为机密的的研究所，也就是F区，这让之前好不容易到达A区的夏若汐有些绝望。
此时的地表已经成为战场，第三帝国的国防军士兵正在抵抗越来越多的外星生物，因为战乱造成的声响，大量被‘暗能’物质感染的变异体也来到战场，它们不顾一切的破坏着这里，因为刀枪不入的抗性，它们在和外星生物进行交战时为国防军提供了部分便利，使的国防军可以称空隙调集虎式坦克，鼠式重型坦克，以及别隆采圆盘和使用无线电让停在远处的古斯塔夫列车炮这类重火力来提供支援。但即使是调集了大量装甲部队和空军，战场的优势还是倒向潮水般的外星生物一边。
军队的撤退
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事情发展到这个地步，国防军发现他们正在打一场注定要输掉的战斗，不管是阻止不断从地下涌出的外星生物还是消灭屡次逃脱的夏若汐，随后国防军开始集结并逐步撤出设施，他们呼叫了空袭和重炮掩护他们。外星生物毫不留情的继续进攻，准备杀死所有还没有撤出的人类。夏若汐穿过这一片屠宰场，穿过A区被轰炸毁坏的上层停机坪。为了避开轰炸，夏若汐躲到了地下车库里，在这里夏若汐找到了一直在寻找的所谓有办法离开这片战场的科学家们，在清空了周围的怪物后，众人乘坐一辆被改装的SUV离开了狼穴基地。
就在夏若汐离开后的数个小时内，AN602炸弹被引爆，整个狼穴基地被爆炸摧毁，大量还未逃生的研究人员和尚未来得及撤离的国防军士兵在爆炸中死亡。部分外星生物在爆炸中存活。
后续
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狼穴基地事件产生的影响是巨大的，它再一次的掏空了第三帝国国防军的战斗力，这是《神州复兴战争》后又一次国防军军力被掏空。
地球本来就因为七年战争变得满目疮痍，部分充满大量资源的地方还被七年战争中第三帝国所使用的‘暗能’物质污染，狼穴基地之后虽然大量外星生物因为不适应地球上的环境而被地球上的细菌和病毒杀死，但仍有部分外星生物存活了下来。
尽管该事件被认为是一起灾难，但却有证据表明这起事件是精心策划的。第三帝国高层似乎早就在为分析水晶做了一段时间的准备，尤其是关于选择进行实验的人物时，竟然选择了还在读大学，几乎什么都不知道的普通平民夏若汐，并且在实验事故发生后，元首认定她还活着并下令抓捕她也让人怀疑。同时那个神秘的男人也一直是一个谜，元首曾试图通过网络云图来查询这个男人的资料，但最终找到的是一份被高度加密的资料，即使是拥有最高权限的元首也无法阅读这篇资料，另外最引人注意的就是这个男人在实验开始前对古德里安·谢泼特说的那句“准备好迎接出乎意料的结果吧”。至于还有谁参与了谋划目前仍未可知。
已知幸存者（部分）
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夏若汐
古德里安·谢泼特
赫尔曼·威廉·戈林
阿道夫·希特勒
神秘男人
罗森堡
数量未知的第三帝国士兵
数量未知的外星生物
附录：各种情况
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时间：
200X年X月XX日→X月XX日
地点:
狼穴基地
结果：
狼穴基地被完全摧毁
因实验失败导致的外星生物徘徊在地球上
交战方：
狼穴基地 | 德意志第三帝国国防军 | 德意志第三帝国装甲核心部队| 德意志第三帝国刺客部队| 外星生物
指挥官：古德里安将军| 隆美尔将军 | 夏若汐
战斗相关情况
狼穴基地科研团队 | 狼穴基地安保团队
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第三帝国国防军士兵 | 别隆采圆盘
鼠式重型坦克| 虎式坦克
第三帝国装甲核心部队| 第三帝国刺客部队 | 各类战斗机与轰炸机
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「外星生物军事单位」
外星生物运输机 | 雷电怪 |外星生物主战部队 |外星生物特种部队
「野生动物」
水螅| 鱼龙 |
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人员伤亡：
几乎所有狼穴基地工作人员
国防军士兵/装甲核心部队/刺客团队/外星生物：大量伤亡
（感觉又挖了一个超大的坑……）
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